summaryrefslogtreecommitdiff
path: root/tests/lexers/jags
diff options
context:
space:
mode:
authorGeorg Brandl <georg@python.org>2021-01-18 21:24:00 +0100
committerGeorg Brandl <georg@python.org>2021-01-18 22:08:36 +0100
commit2a3d3a7d5b9c60dedf6638d876161d9563faebcf (patch)
tree809c0b4a686db98f5954afa1944404cd9652c6b2 /tests/lexers/jags
parentf0445be718da83541ea3401aad882f3937147263 (diff)
downloadpygments-git-examplefiles.tar.gz
Move test_examplefiles to new tests/lexers scheme.examplefiles
Diffstat (limited to 'tests/lexers/jags')
-rw-r--r--tests/lexers/jags/example.txt629
1 files changed, 629 insertions, 0 deletions
diff --git a/tests/lexers/jags/example.txt b/tests/lexers/jags/example.txt
new file mode 100644
index 00000000..80e46afb
--- /dev/null
+++ b/tests/lexers/jags/example.txt
@@ -0,0 +1,629 @@
+---input---
+# lsat.jags example from classic-bugs examples in JAGS
+# See http://sourceforge.net/projects/mcmc-jags/files/Examples/2.x/
+var
+ response[R,T], m[R], culm[R], alpha[T], a[T], theta[N], r[N,T],
+ p[N,T], beta, theta.new, p.theta[T], p.item[R,T], P.theta[R];
+data {
+ for (j in 1:culm[1]) {
+ r[j, ] <- response[1, ];
+ }
+ for (i in 2:R) {
+ for (j in (culm[i - 1] + 1):culm[i]) {
+ r[j, ] <- response[i, ];
+ }
+ }
+}
+model {
+ # 2-parameter Rasch model
+ for (j in 1:N) {
+ for (k in 1:T) {
+ probit(p[j,k]) <- delta[k]*theta[j] - eta[k];
+ r[j,k] ~ dbern(p[j,k]);
+ }
+ theta[j] ~ dnorm(0,1);
+ }
+
+ # Priors
+ for (k in 1:T) {
+ eta[k] ~ dnorm(0,0.0001);
+ e[k] <- eta[k] - mean(eta[]); # sum-to-zero constraint
+
+ delta[k] ~ dnorm(0,1) T(0,); # constrain variance to 1, slope +ve
+ d[k] <- delta[k]/pow(prod(delta), 1/T); # PRODUCT_k (d_k) = 1
+
+ g[k] <- e[k]/d[k]; # equivalent to B&A's threshold parameters
+ }
+
+ # Compute probability of response pattern i, for later use in computing G^2
+ theta.new ~ dnorm(0,1); # ability parameter for random student
+ for(k in 1:T) {
+ probit(p.theta[k]) <- delta[k]*theta.new - eta[k];
+ for(i in 1:R) {
+ p.item[i,k] <- p.theta[k]^response[i,k] * (1-p.theta[k])^(1-response[i,k]);
+ }
+ }
+ for(i in 1:R) {
+ P.theta[i] <- prod(p.item[i,])
+ }
+}
+
+---tokens---
+'# lsat.jags example from classic-bugs examples in JAGS' Comment.Single
+'\n' Text
+
+'# See http://sourceforge.net/projects/mcmc-jags/files/Examples/2.x/' Comment.Single
+'\n' Text
+
+'var' Keyword.Declaration
+'\n ' Text
+'response' Name
+'[' Punctuation
+'R' Name
+',' Punctuation
+'T' Name
+']' Punctuation
+',' Punctuation
+' ' Text
+'m' Name
+'[' Punctuation
+'R' Name
+']' Punctuation
+',' Punctuation
+' ' Text
+'culm' Name
+'[' Punctuation
+'R' Name
+']' Punctuation
+',' Punctuation
+' ' Text
+'alpha' Name
+'[' Punctuation
+'T' Name
+']' Punctuation
+',' Punctuation
+' ' Text
+'a' Name
+'[' Punctuation
+'T' Name
+']' Punctuation
+',' Punctuation
+' ' Text
+'theta' Name
+'[' Punctuation
+'N' Name
+']' Punctuation
+',' Punctuation
+' ' Text
+'r' Name
+'[' Punctuation
+'N' Name
+',' Punctuation
+'T' Name
+']' Punctuation
+',' Punctuation
+'\n ' Text
+'p' Name
+'[' Punctuation
+'N' Name
+',' Punctuation
+'T' Name
+']' Punctuation
+',' Punctuation
+' ' Text
+'beta' Name
+',' Punctuation
+' ' Text
+'theta.new' Name
+',' Punctuation
+' ' Text
+'p.theta' Name
+'[' Punctuation
+'T' Name
+']' Punctuation
+',' Punctuation
+' ' Text
+'p.item' Name
+'[' Punctuation
+'R' Name
+',' Punctuation
+'T' Name
+']' Punctuation
+',' Punctuation
+' ' Text
+'P.theta' Name
+'[' Punctuation
+'R' Name
+']' Punctuation
+';' Punctuation
+'\n' Text
+
+'data' Keyword.Namespace
+' ' Text
+'{' Punctuation
+'\n ' Text
+'for' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'(' Punctuation
+'j' Name
+' ' Text
+'in' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'1' Literal.Number
+':' Punctuation
+'culm' Name
+'[' Punctuation
+'1' Literal.Number
+']' Punctuation
+')' Punctuation
+' ' Text
+'{' Punctuation
+'\n ' Text
+'r' Name
+'[' Punctuation
+'j' Name
+',' Punctuation
+' ' Text
+']' Punctuation
+' ' Text
+'<-' Operator
+' ' Text
+'response' Name
+'[' Punctuation
+'1' Literal.Number
+',' Punctuation
+' ' Text
+']' Punctuation
+';' Punctuation
+'\n ' Text
+'}' Punctuation
+'\n ' Text
+'for' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'(' Punctuation
+'i' Name
+' ' Text
+'in' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'2' Literal.Number
+':' Punctuation
+'R' Name
+')' Punctuation
+' ' Text
+'{' Punctuation
+'\n ' Text
+'for' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'(' Punctuation
+'j' Name
+' ' Text
+'in' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'(' Punctuation
+'culm' Name
+'[' Punctuation
+'i' Name
+' ' Text
+'-' Operator
+' ' Text
+'1' Literal.Number
+']' Punctuation
+' ' Text
+'+' Operator
+' ' Text
+'1' Literal.Number
+')' Punctuation
+':' Punctuation
+'culm' Name
+'[' Punctuation
+'i' Name
+']' Punctuation
+')' Punctuation
+' ' Text
+'{' Punctuation
+'\n ' Text
+'r' Name
+'[' Punctuation
+'j' Name
+',' Punctuation
+' ' Text
+']' Punctuation
+' ' Text
+'<-' Operator
+' ' Text
+'response' Name
+'[' Punctuation
+'i' Name
+',' Punctuation
+' ' Text
+']' Punctuation
+';' Punctuation
+'\n ' Text
+'}' Punctuation
+'\n ' Text
+'}' Punctuation
+'\n' Text
+
+'}' Punctuation
+'\n' Text
+
+'model' Keyword.Namespace
+' ' Text
+'{' Punctuation
+'\n ' Text
+'# 2-parameter Rasch model' Comment.Single
+'\n ' Text
+'for' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'(' Punctuation
+'j' Name
+' ' Text
+'in' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'1' Literal.Number
+':' Punctuation
+'N' Name
+')' Punctuation
+' ' Text
+'{' Punctuation
+'\n ' Text
+'for' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'(' Punctuation
+'k' Name
+' ' Text
+'in' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'1' Literal.Number
+':' Punctuation
+'T' Name
+')' Punctuation
+' ' Text
+'{' Punctuation
+'\n ' Text
+'probit' Name.Builtin
+'(' Punctuation
+'p' Name
+'[' Punctuation
+'j' Name
+',' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+')' Punctuation
+' ' Text
+'<-' Operator
+' ' Text
+'delta' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+'*' Operator
+'theta' Name
+'[' Punctuation
+'j' Name
+']' Punctuation
+' ' Text
+'-' Operator
+' ' Text
+'eta' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+';' Punctuation
+'\n ' Text
+'r' Name
+'[' Punctuation
+'j' Name
+',' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+' ' Text
+'~' Operator
+' ' Text
+'dbern' Name.Builtin
+'(' Punctuation
+'p' Name
+'[' Punctuation
+'j' Name
+',' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+')' Punctuation
+';' Punctuation
+'\n ' Text
+'}' Punctuation
+'\n ' Text
+'theta' Name
+'[' Punctuation
+'j' Name
+']' Punctuation
+' ' Text
+'~' Operator
+' ' Text
+'dnorm' Name.Builtin
+'(' Punctuation
+'0' Literal.Number
+',' Punctuation
+'1' Literal.Number
+')' Punctuation
+';' Punctuation
+'\n ' Text
+'}' Punctuation
+'\n\n ' Text
+'# Priors' Comment.Single
+'\n ' Text
+'for' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'(' Punctuation
+'k' Name
+' ' Text
+'in' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'1' Literal.Number
+':' Punctuation
+'T' Name
+')' Punctuation
+' ' Text
+'{' Punctuation
+'\n ' Text
+'eta' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+' ' Text
+'~' Operator
+' ' Text
+'dnorm' Name.Builtin
+'(' Punctuation
+'0' Literal.Number
+',' Punctuation
+'0.0001' Literal.Number
+')' Punctuation
+';' Punctuation
+' \n ' Text
+'e' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+' ' Text
+'<-' Operator
+' ' Text
+'eta' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+' ' Text
+'-' Operator
+' ' Text
+'mean' Name.Builtin
+'(' Punctuation
+'eta' Name
+'[' Punctuation
+']' Punctuation
+')' Punctuation
+';' Punctuation
+' ' Text
+'# sum-to-zero constraint' Comment.Single
+'\n\n ' Text
+'delta' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+' ' Text
+'~' Operator
+' ' Text
+'dnorm' Name.Builtin
+'(' Punctuation
+'0' Literal.Number
+',' Punctuation
+'1' Literal.Number
+')' Punctuation
+' ' Text
+'T' Name.Builtin
+'(' Punctuation
+'0' Literal.Number
+',' Punctuation
+')' Punctuation
+';' Punctuation
+' ' Text
+'# constrain variance to 1, slope +ve' Comment.Single
+'\n ' Text
+'d' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+' ' Text
+'<-' Operator
+' ' Text
+'delta' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+'/' Operator
+'pow' Name.Builtin
+'(' Punctuation
+'prod' Name.Builtin
+'(' Punctuation
+'delta' Name
+')' Punctuation
+',' Punctuation
+' ' Text
+'1' Literal.Number
+'/' Operator
+'T' Name
+')' Punctuation
+';' Punctuation
+' ' Text
+'# PRODUCT_k (d_k) = 1' Comment.Single
+'\n \n ' Text
+'g' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+' ' Text
+'<-' Operator
+' ' Text
+'e' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+'/' Operator
+'d' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+';' Punctuation
+' ' Text
+"# equivalent to B&A's threshold parameters" Comment.Single
+'\n ' Text
+'}' Punctuation
+'\n\n ' Text
+'# Compute probability of response pattern i, for later use in computing G^2' Comment.Single
+'\n ' Text
+'theta.new' Name
+' ' Text
+'~' Operator
+' ' Text
+'dnorm' Name.Builtin
+'(' Punctuation
+'0' Literal.Number
+',' Punctuation
+'1' Literal.Number
+')' Punctuation
+';' Punctuation
+' ' Text
+'# ability parameter for random student ' Comment.Single
+'\n ' Text
+'for' Keyword.Reserved
+'(' Punctuation
+'k' Name
+' ' Text
+'in' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'1' Literal.Number
+':' Punctuation
+'T' Name
+')' Punctuation
+' ' Text
+'{' Punctuation
+'\n ' Text
+'probit' Name.Builtin
+'(' Punctuation
+'p.theta' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+')' Punctuation
+' ' Text
+'<-' Operator
+' ' Text
+'delta' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+'*' Operator
+'theta.new' Name
+' ' Text
+'-' Operator
+' ' Text
+'eta' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+';' Punctuation
+'\n ' Text
+'for' Keyword.Reserved
+'(' Punctuation
+'i' Name
+' ' Text
+'in' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'1' Literal.Number
+':' Punctuation
+'R' Name
+')' Punctuation
+' ' Text
+'{' Punctuation
+'\n ' Text
+'p.item' Name
+'[' Punctuation
+'i' Name
+',' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+' ' Text
+'<-' Operator
+' ' Text
+'p.theta' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+'^' Operator
+'response' Name
+'[' Punctuation
+'i' Name
+',' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+' ' Text
+'*' Operator
+' ' Text
+'(' Punctuation
+'1' Literal.Number
+'-' Operator
+'p.theta' Name
+'[' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+')' Punctuation
+'^' Operator
+'(' Punctuation
+'1' Literal.Number
+'-' Operator
+'response' Name
+'[' Punctuation
+'i' Name
+',' Punctuation
+'k' Name
+']' Punctuation
+')' Punctuation
+';' Punctuation
+'\n ' Text
+'}' Punctuation
+'\n ' Text
+'}' Punctuation
+' \n ' Text
+'for' Keyword.Reserved
+'(' Punctuation
+'i' Name
+' ' Text
+'in' Keyword.Reserved
+' ' Text
+'1' Literal.Number
+':' Punctuation
+'R' Name
+')' Punctuation
+' ' Text
+'{' Punctuation
+' \n ' Text
+'P.theta' Name
+'[' Punctuation
+'i' Name
+']' Punctuation
+' ' Text
+'<-' Operator
+' ' Text
+'prod' Name.Builtin
+'(' Punctuation
+'p.item' Name
+'[' Punctuation
+'i' Name
+',' Punctuation
+']' Punctuation
+')' Punctuation
+'\n ' Text
+'}' Punctuation
+'\n' Text
+
+'}' Punctuation
+'\n' Text