diff options
| author | Georg Brandl <georg@python.org> | 2021-01-18 21:24:00 +0100 |
|---|---|---|
| committer | Georg Brandl <georg@python.org> | 2021-01-18 22:08:36 +0100 |
| commit | 2a3d3a7d5b9c60dedf6638d876161d9563faebcf (patch) | |
| tree | 809c0b4a686db98f5954afa1944404cd9652c6b2 /tests/lexers/jags | |
| parent | f0445be718da83541ea3401aad882f3937147263 (diff) | |
| download | pygments-git-examplefiles.tar.gz | |
Move test_examplefiles to new tests/lexers scheme.examplefiles
Diffstat (limited to 'tests/lexers/jags')
| -rw-r--r-- | tests/lexers/jags/example.txt | 629 |
1 files changed, 629 insertions, 0 deletions
diff --git a/tests/lexers/jags/example.txt b/tests/lexers/jags/example.txt new file mode 100644 index 00000000..80e46afb --- /dev/null +++ b/tests/lexers/jags/example.txt @@ -0,0 +1,629 @@ +---input--- +# lsat.jags example from classic-bugs examples in JAGS +# See http://sourceforge.net/projects/mcmc-jags/files/Examples/2.x/ +var + response[R,T], m[R], culm[R], alpha[T], a[T], theta[N], r[N,T], + p[N,T], beta, theta.new, p.theta[T], p.item[R,T], P.theta[R]; +data { + for (j in 1:culm[1]) { + r[j, ] <- response[1, ]; + } + for (i in 2:R) { + for (j in (culm[i - 1] + 1):culm[i]) { + r[j, ] <- response[i, ]; + } + } +} +model { + # 2-parameter Rasch model + for (j in 1:N) { + for (k in 1:T) { + probit(p[j,k]) <- delta[k]*theta[j] - eta[k]; + r[j,k] ~ dbern(p[j,k]); + } + theta[j] ~ dnorm(0,1); + } + + # Priors + for (k in 1:T) { + eta[k] ~ dnorm(0,0.0001); + e[k] <- eta[k] - mean(eta[]); # sum-to-zero constraint + + delta[k] ~ dnorm(0,1) T(0,); # constrain variance to 1, slope +ve + d[k] <- delta[k]/pow(prod(delta), 1/T); # PRODUCT_k (d_k) = 1 + + g[k] <- e[k]/d[k]; # equivalent to B&A's threshold parameters + } + + # Compute probability of response pattern i, for later use in computing G^2 + theta.new ~ dnorm(0,1); # ability parameter for random student + for(k in 1:T) { + probit(p.theta[k]) <- delta[k]*theta.new - eta[k]; + for(i in 1:R) { + p.item[i,k] <- p.theta[k]^response[i,k] * (1-p.theta[k])^(1-response[i,k]); + } + } + for(i in 1:R) { + P.theta[i] <- prod(p.item[i,]) + } +} + +---tokens--- +'# lsat.jags example from classic-bugs examples in JAGS' Comment.Single +'\n' Text + +'# See http://sourceforge.net/projects/mcmc-jags/files/Examples/2.x/' Comment.Single +'\n' Text + +'var' Keyword.Declaration +'\n ' Text +'response' Name +'[' Punctuation +'R' Name +',' Punctuation +'T' Name +']' Punctuation +',' Punctuation +' ' Text +'m' Name +'[' Punctuation +'R' Name +']' Punctuation +',' Punctuation +' ' Text +'culm' Name +'[' Punctuation +'R' Name +']' Punctuation +',' Punctuation +' ' Text +'alpha' Name +'[' Punctuation +'T' Name +']' Punctuation +',' Punctuation +' ' Text +'a' Name +'[' Punctuation +'T' Name +']' Punctuation +',' Punctuation +' ' Text +'theta' Name +'[' Punctuation +'N' Name +']' Punctuation +',' Punctuation +' ' Text +'r' Name +'[' Punctuation +'N' Name +',' Punctuation +'T' Name +']' Punctuation +',' Punctuation +'\n ' Text +'p' Name +'[' Punctuation +'N' Name +',' Punctuation +'T' Name +']' Punctuation +',' Punctuation +' ' Text +'beta' Name +',' Punctuation +' ' Text +'theta.new' Name +',' Punctuation +' ' Text +'p.theta' Name +'[' Punctuation +'T' Name +']' Punctuation +',' Punctuation +' ' Text +'p.item' Name +'[' Punctuation +'R' Name +',' Punctuation +'T' Name +']' Punctuation +',' Punctuation +' ' Text +'P.theta' Name +'[' Punctuation +'R' Name +']' Punctuation +';' Punctuation +'\n' Text + +'data' Keyword.Namespace +' ' Text +'{' Punctuation +'\n ' Text +'for' Keyword.Reserved +' ' Text +'(' Punctuation +'j' Name +' ' Text +'in' Keyword.Reserved +' ' Text +'1' Literal.Number +':' Punctuation +'culm' Name +'[' Punctuation +'1' Literal.Number +']' Punctuation +')' Punctuation +' ' Text +'{' Punctuation +'\n ' Text +'r' Name +'[' Punctuation +'j' Name +',' Punctuation +' ' Text +']' Punctuation +' ' Text +'<-' Operator +' ' Text +'response' Name +'[' Punctuation +'1' Literal.Number +',' Punctuation +' ' Text +']' Punctuation +';' Punctuation +'\n ' Text +'}' Punctuation +'\n ' Text +'for' Keyword.Reserved +' ' Text +'(' Punctuation +'i' Name +' ' Text +'in' Keyword.Reserved +' ' Text +'2' Literal.Number +':' Punctuation +'R' Name +')' Punctuation +' ' Text +'{' Punctuation +'\n ' Text +'for' Keyword.Reserved +' ' Text +'(' Punctuation +'j' Name +' ' Text +'in' Keyword.Reserved +' ' Text +'(' Punctuation +'culm' Name +'[' Punctuation +'i' Name +' ' Text +'-' Operator +' ' Text +'1' Literal.Number +']' Punctuation +' ' Text +'+' Operator +' ' Text +'1' Literal.Number +')' Punctuation +':' Punctuation +'culm' Name +'[' Punctuation +'i' Name +']' Punctuation +')' Punctuation +' ' Text +'{' Punctuation +'\n ' Text +'r' Name +'[' Punctuation +'j' Name +',' Punctuation +' ' Text +']' Punctuation +' ' Text +'<-' Operator +' ' Text +'response' Name +'[' Punctuation +'i' Name +',' Punctuation +' ' Text +']' Punctuation +';' Punctuation +'\n ' Text +'}' Punctuation +'\n ' Text +'}' Punctuation +'\n' Text + +'}' Punctuation +'\n' Text + +'model' Keyword.Namespace +' ' Text +'{' Punctuation +'\n ' Text +'# 2-parameter Rasch model' Comment.Single +'\n ' Text +'for' Keyword.Reserved +' ' Text +'(' Punctuation +'j' Name +' ' Text +'in' Keyword.Reserved +' ' Text +'1' Literal.Number +':' Punctuation +'N' Name +')' Punctuation +' ' Text +'{' Punctuation +'\n ' Text +'for' Keyword.Reserved +' ' Text +'(' Punctuation +'k' Name +' ' Text +'in' Keyword.Reserved +' ' Text +'1' Literal.Number +':' Punctuation +'T' Name +')' Punctuation +' ' Text +'{' Punctuation +'\n ' Text +'probit' Name.Builtin +'(' Punctuation +'p' Name +'[' Punctuation +'j' Name +',' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +')' Punctuation +' ' Text +'<-' Operator +' ' Text +'delta' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +'*' Operator +'theta' Name +'[' Punctuation +'j' Name +']' Punctuation +' ' Text +'-' Operator +' ' Text +'eta' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +';' Punctuation +'\n ' Text +'r' Name +'[' Punctuation +'j' Name +',' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +' ' Text +'~' Operator +' ' Text +'dbern' Name.Builtin +'(' Punctuation +'p' Name +'[' Punctuation +'j' Name +',' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +')' Punctuation +';' Punctuation +'\n ' Text +'}' Punctuation +'\n ' Text +'theta' Name +'[' Punctuation +'j' Name +']' Punctuation +' ' Text +'~' Operator +' ' Text +'dnorm' Name.Builtin +'(' Punctuation +'0' Literal.Number +',' Punctuation +'1' Literal.Number +')' Punctuation +';' Punctuation +'\n ' Text +'}' Punctuation +'\n\n ' Text +'# Priors' Comment.Single +'\n ' Text +'for' Keyword.Reserved +' ' Text +'(' Punctuation +'k' Name +' ' Text +'in' Keyword.Reserved +' ' Text +'1' Literal.Number +':' Punctuation +'T' Name +')' Punctuation +' ' Text +'{' Punctuation +'\n ' Text +'eta' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +' ' Text +'~' Operator +' ' Text +'dnorm' Name.Builtin +'(' Punctuation +'0' Literal.Number +',' Punctuation +'0.0001' Literal.Number +')' Punctuation +';' Punctuation +' \n ' Text +'e' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +' ' Text +'<-' Operator +' ' Text +'eta' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +' ' Text +'-' Operator +' ' Text +'mean' Name.Builtin +'(' Punctuation +'eta' Name +'[' Punctuation +']' Punctuation +')' Punctuation +';' Punctuation +' ' Text +'# sum-to-zero constraint' Comment.Single +'\n\n ' Text +'delta' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +' ' Text +'~' Operator +' ' Text +'dnorm' Name.Builtin +'(' Punctuation +'0' Literal.Number +',' Punctuation +'1' Literal.Number +')' Punctuation +' ' Text +'T' Name.Builtin +'(' Punctuation +'0' Literal.Number +',' Punctuation +')' Punctuation +';' Punctuation +' ' Text +'# constrain variance to 1, slope +ve' Comment.Single +'\n ' Text +'d' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +' ' Text +'<-' Operator +' ' Text +'delta' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +'/' Operator +'pow' Name.Builtin +'(' Punctuation +'prod' Name.Builtin +'(' Punctuation +'delta' Name +')' Punctuation +',' Punctuation +' ' Text +'1' Literal.Number +'/' Operator +'T' Name +')' Punctuation +';' Punctuation +' ' Text +'# PRODUCT_k (d_k) = 1' Comment.Single +'\n \n ' Text +'g' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +' ' Text +'<-' Operator +' ' Text +'e' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +'/' Operator +'d' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +';' Punctuation +' ' Text +"# equivalent to B&A's threshold parameters" Comment.Single +'\n ' Text +'}' Punctuation +'\n\n ' Text +'# Compute probability of response pattern i, for later use in computing G^2' Comment.Single +'\n ' Text +'theta.new' Name +' ' Text +'~' Operator +' ' Text +'dnorm' Name.Builtin +'(' Punctuation +'0' Literal.Number +',' Punctuation +'1' Literal.Number +')' Punctuation +';' Punctuation +' ' Text +'# ability parameter for random student ' Comment.Single +'\n ' Text +'for' Keyword.Reserved +'(' Punctuation +'k' Name +' ' Text +'in' Keyword.Reserved +' ' Text +'1' Literal.Number +':' Punctuation +'T' Name +')' Punctuation +' ' Text +'{' Punctuation +'\n ' Text +'probit' Name.Builtin +'(' Punctuation +'p.theta' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +')' Punctuation +' ' Text +'<-' Operator +' ' Text +'delta' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +'*' Operator +'theta.new' Name +' ' Text +'-' Operator +' ' Text +'eta' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +';' Punctuation +'\n ' Text +'for' Keyword.Reserved +'(' Punctuation +'i' Name +' ' Text +'in' Keyword.Reserved +' ' Text +'1' Literal.Number +':' Punctuation +'R' Name +')' Punctuation +' ' Text +'{' Punctuation +'\n ' Text +'p.item' Name +'[' Punctuation +'i' Name +',' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +' ' Text +'<-' Operator +' ' Text +'p.theta' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +'^' Operator +'response' Name +'[' Punctuation +'i' Name +',' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +' ' Text +'*' Operator +' ' Text +'(' Punctuation +'1' Literal.Number +'-' Operator +'p.theta' Name +'[' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +')' Punctuation +'^' Operator +'(' Punctuation +'1' Literal.Number +'-' Operator +'response' Name +'[' Punctuation +'i' Name +',' Punctuation +'k' Name +']' Punctuation +')' Punctuation +';' Punctuation +'\n ' Text +'}' Punctuation +'\n ' Text +'}' Punctuation +' \n ' Text +'for' Keyword.Reserved +'(' Punctuation +'i' Name +' ' Text +'in' Keyword.Reserved +' ' Text +'1' Literal.Number +':' Punctuation +'R' Name +')' Punctuation +' ' Text +'{' Punctuation +' \n ' Text +'P.theta' Name +'[' Punctuation +'i' Name +']' Punctuation +' ' Text +'<-' Operator +' ' Text +'prod' Name.Builtin +'(' Punctuation +'p.item' Name +'[' Punctuation +'i' Name +',' Punctuation +']' Punctuation +')' Punctuation +'\n ' Text +'}' Punctuation +'\n' Text + +'}' Punctuation +'\n' Text |
